Poleg tega da je prepredena s številnimi planinskimi stezami in naravnimi lepotami, ima Medvednica več planinskih koč, do katerih se splača povzpeti, včasih zaradi razgleda ter vedno zaradi dobrega okrepčila ali pa prenočišča. Planinske steze 9, 11 in 45 peljejo do Planinske koče Risnjak, od tam pa je možno priti do Grafičara, Kamenih svatov in Kraljičinega zdenca. Po planinski stezi 16 pridete do Planinske koče Runolist, zraven katere je glavna Sljemenska cesta in avtobusna postaja. Ena izmed najlepših je Planinska koča Grafičar, ki je na 864 metrih nadmorske višine, do nje pa lahko pridete po več stezah, med katerimi je najbolj poznana tista, ki se začne pri restavraciji Lagvić v Šestinah. Do Planinske koče Lipa ni cestnih dostopov, med vikendi in prazniki pa lahko na vrh Rog pridejo samo pohodniki, ko lahko tam tudi prespijo.  Do koče lahko pridete iz Planine Donje ter prelaza Vejalnica nad Čučerjem. Največja Planinska koča Ivan Pačkovski, bolj poznana kot Puntijarka, je na 957 metrih nadmorske višine, pod vrhom Puntijarka. Za razliko od večine koč, ki delajo le med vikendom in praznikom, je Grafičar odprt vsak dan razen ob ponedeljkih, Puntijarka pa vsak dan. V bližini travnika Činovnička livada je Planinska koča Grofica, priljubljena in zelo obiskana med vikendom, znana pa je tudi po polmetrskem zagrebškem zrezku. Po planinski stezi št. 1 lahko pridete do Planinske koče Vugrovec, do katere lahko pridete tudi z avtobusom 261 s postaje Dubec. V planinskih kočah pogosto prevladuje dobro vzdušje, zlasti zaradi dejstva, da je po sladkem naporu v njih mogoče poiskati izreden greh ali pa hladno pivo za okrepčilo ali osvežitev.